La historia se centra en Tetsuya Tsurugi, un joven huérfano que creció bajo la tutela de Kenzo Kabuto, quien es el padre del piloto de Mazinger Z, Koji Kabuto. Kenzo Kabuto es el creador de una nueva y mejorada versión de Mazinger, creada a partir de la versión de Mazinger Z de su padre, de estructura fuerte y diseñada para pelear en contra de los nuevo enemigos de la Humanidad, el Imperio de Mikenes, liderado por el Emperador de la Oscuridad y su ejército de robots guerreros. Kenzo le dio el Gran Mazinger a Tetsuya para que lo pilotara, quien es apoyado en combate por Jun Hono, piloto del robot Venus A
